제 1회 KIDDS 단백질 예측 대회
- Chaok Seok
- 2023년 2월 22일
- 1분 분량
최종 수정일: 2023년 6월 27일
1. 제 1회 대회 타겟 T001. 항체-항원 시스템 T002. 항체-항원 시스템 * 자세한 문제 정보 및 제출 포맷은 참가 등록 팀에 한하여 3/6일에 개별 이메일로 전달 예정.
2. 대회 일정
3. 참가 방법 - 구글 폼 (여기) 을 통해
- 대회 기간 동안 (2/24~6/15) 참가팀 등록 가능
- 1인 이상의 인원으로 구성된 팀 단위 등록. - 1인이 복수 팀 등록 및 참여 가능.
- 기본적인 baseline 방법 몇 종류는 (AF2-multimer + plddt 이용한 랭킹)은 주최 측에서 진행 예정이니 그와 충분히 차별성이 있는 방법으로 참여 부탁드립니다.
참여 가능한 방법 예시)
1) 차별성 있는 고유의 MSA 활용
2) ESMfold 활용하여 antibody 모델링 후 템플릿으로 활용
3) literature로부터 찾은 실험 결과 활용하여 랭킹
4) plddt/pae 값에 추가 ML layer 적용하여 랭킹
참여 지양 방법 예시)
1) plddt 대신 pae/pTM/distogram 등으로 랭킹
2) AF2-multimer 대신 AF2-monomeric version
- 직접 참여가 어려우나 이미 학계에 공개된 특정 방법이 궁금하신 분들께서는 구글 폼에서 참여 그룹 이름을 “방법 제안”으로 적어주시고 구체적인 내용을 아래 참여 방법에 적어주시면 주최 측 에서 아이디어의 차별성을 고려하여 최대한 실제 구현해보도록 하겠습니다.
4. Round 1-3 결과
5. 제 1회 대회 추가 예정 문제들 (2023년도 하반기 예정)
Round 4. Antibody-antigen complex structure prediction Round 5. Affinity optimization
Round 6. Antibody design
6. 대회 조직 조직위원회: 석차옥 (서울대학교, 갤럭스), 박한범 (KIST), 박근완 (KIST)
데이터 제공/검증 실험: 진형승, 김효리 (서울아산병원), 송지준 (KAIST)
Funding: 차세대 인실리코 단백질 디자인 센터
문의: 박한범 (hahnbeom@kist.re.kr)
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